HDFS - billig im Cluster speichern

isotopp image Kristian Köhntopp -
June 11, 2012
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Wer Clustern will, der muß erst mal einen solchen haben. Also, einen Cluster von möglichst vielen Rechnern. Die Anforderungen sind dabei klar: Man möchte Hardware haben, die möglichst billig ist - für Serverplatten, Speicher mit Fehlerkorrektur (ECC), und dergleichen Luxus ist kein Geld da, denn man möchte das gesparte Geld lieber in mehr Rechner stecken.

Also Billighardware kaufen? Nein! Denn auch die laufenden Kosten möchte man niedrig halten - der Rechner sollte also klein sein, und möglichst geringe laufende Kosten haben, also möglichst wenig Strom aufnehmen und bei möglichst hohen Zuluft-Temperaturen noch funktionieren. Die oben angedeutete Desktop-Kiste wird in dieser Form und mit diesem Formfaktor also niemandem Freude bereiten.

“Klein” heißt in unserem Fall, daß wir mehr Schachteln in ein Standard-Rack hinein bekommen, wenig Strom aufnehmen heißt, daß wir wenig Strom bezahlen müssen und wenig Strom dazu verbrauchen, um den in Wärme umgewandelten Strom nach dem Verbrauch per Klimaanlage wieder nach draußen zu schaffen. Und hohe Zuluft-Temperaturen heißt, daß wir dicht packen können und daß wir die Klimaanlage so klein als möglich dimensionieren können, also weniger Strom für Kühlung und mehr Strom für das Rechnen ausgeben können.

Wenn man das Ganze groß genug betreibt - also mit n-stelliger Anzahl von Kisten, dann lohnt es sich, Metriken in Operations/Euro und Operations/Watt sowie Operations/Grundfläche bzw. Kubikmeter aufzustellen und dann auf dem Problem ein wenig linear zu optimieren, damit man möglichst viel Bumms pro Euro kauft.

Wenn man eher mittelständische Haushaltsgrößen ins Auge faßt, dann geht man zu seinem Standard-Hersteller für RZ-Hardware und schaut mal, was die an möglichst einfachen Pizzaschachteln im Angebot haben.

HP DL 160 Gen 6

Pizzablech “HP DL160 Generation 6” für 4 Sorten Käse.

Dieses Blech wiegt etwas über 12 Kilo, ist die üblichen 19" breit, eine Höheneinheit im Rack hoch und etwas unter 70cm tief. Eine Beispielkonfiguration enthielte etwa eine 6-Core CPU, 24 GB RAM, 4 Platten mit jeweils einem Terabyte als JBOD und einen bzw. zwei Gigabit-Netzwerkports, und sie kommt mit ein wenig Gehampel für unter 2000 EUR/Stück. Eine doppelt so hohe Kiste könnte statt 4 Platten deren 12 fassen, und ein damit aufgebauter Cluster hätte weniger CPU und mehr Plattenspeicher.

Das ist sehr unangestrengte Hardware - wenn man ein wenig mehr Hardcore shoppen geht, dann bekommt man leicht etwas mit größeren Platten für wenig Geld, wahrscheinlich aber auch mit einer schlechteren Ausfallrate. Das ganze Gelöt kommt nun in einige Racks, die wir mit Top-of-Rack Switches sinnvoll in einem separaten Netz zusammenknoten.

HDFS - Hadoop Filesystem

Jetzt haben wir billige Platten von schlechter Qualität als JBOD ohne das geringste bischen Redundanz, die wir einzeln und lokal in irgendein Verzeichnis unsers Servers mounten. HDFS, das Hadoop Filesystem, ist ein verteiltes Dateisystem - es verwendet das vorhandene lokale Dateisystem auf Einzelplatten schlechter Qualität, um daraus schnellen, parallel ansprechbaren und redundanten Speicher im Cluster zu bauen.

HDFS setzt dabei nur eine begrenzte Zahl von Operationen um - ein HDFS ist kein vollwertiges Dateisystem im Sinne des Posix-Standards, sondern man kann es sich mehr als eine Art verteilten und massiv parallelen FTP-Server vorstellen: Das Dateisystem hat die Operationen GET, PUT und DELETE, sowie neuerdings auch noch APPEND, um Daten an eine bestehende Datei anhängen zu können. Ein SEEK, READ oder WRITE existieren jedoch nicht, Locking auch nicht.

Entsprechend gibt es HDFS FUSE-Plugins, aber eben nur im Rahmen der Grenzen der Operationen von HDFS.

Ein Hadoop Datanode

Ein Hadoop-Datanode

HDFS startet zu diesem Zweck auf jedem Rechner mit nutzbaren Platten einen Prozeß namens Datanode, und an zentraler Stelle einen Verwaltungsprozeß namens NameNode. Die Namenode kümmert sich um die Verwaltung von Dateinamen und um das Wiederfinden von Blöcken. Sie zerteilt sehr große Dateien in vergleichsweise grobe Schnetzel von 128 MB Größe und speichert dann jeden dieser “Blöcke” genannten 128 MB-Schnetzel mehrfach auf unterschiedlichen Datanodes ab. Dabei ist es wichtig, sich nicht von der Nomenklatur “Block” ablenken zu lassen: Ein Block ist ein Stück Datei, das bis zu 128 MB groß sein kann, aber bei kleineren Dateien eben auch kürzer. Es handelt sich nicht um Blöcke fester Größe wie bei einem richtigen Dateissystem.

HDFS speichert die Daten auch nicht selbst ab: Es verwendet ein lokales Dateisystem, zum Beispiel Linux ext4 oder xfs, um Dateien lokal zu verwalten und liefert nur eine einheitliche Clustersicht auf die Dinge. HDFS kümmert sich also nur um die verteilten Aspekte des Dateisystems, und überläßt jedem lokalen Knoten die Arbeit, das tatsächlich irgendwo auf eine Platte zu malen.

[root@hadoop-115 finalized]# pwd
/srv/hadoop/data01/dfs/dn/current/BP-1321238634-10.196.68.149-1338912643577/current/finalized
[root@hadoop-115 finalized]# ls -lh blk_1025864654234871634*
-rw------- 1 hdfs hdfs 128M Jun  6 13:37 blk_1025864654234871634
-rw------- 1 hdfs hdfs 1.1M Jun  6 13:37 blk_1025864654234871634_8941.meta

Das Mountschema im Beispiel ist /srv/hadoop/data{n}. Auf jeder lokalen Platte gibt es einen Ordner /dfs/dn (Distributed Filesystem, Datanode), in dem die Blöcke abgelegt werden. Wir sehen hier irgendeinen namenlosen 128 MB Block und die Metadaten zu diesem Block. Man braucht die Daten der Namenode, um aus diesen Dateifetzen wieder sinnvoll benannte und eingereihte Dateien zusammenzusetzen.

Dabei geht das System durchaus pfiffig vor.

Zum einen will man ja, daß die Daten redundant gespeichert sind. Daher werden per Default 3 Kopien von jedem Block angelegt, und natürlich liegt jede Kopie auf einer anderen Maschine. Tatsächlich kann man in die Namenode einen Rackverteilungsplan einpflegen und dann sorgt die Namenode auch dafür, daß zwei der Kopien vergleichsweise dicht beeinander liegen und eine weiter entfernt, in einem anderen Rack. So ist sichergestellt, daß immer mindestens eine Kopie der Daten erhalten bleibt - auch dann, wenn mal ein ganzes Rack umfällt, der Switch oben im Rack verendet oder ein Sack fehlgeschlagener Kernelupdates einen Teil der Rechenzentrums-Population auslöscht.

Schreibzugriff

Ein Schreibzugriff in ein HDFS hinein.

Zum anderen will man auch, daß der ganze Kram parallel abläuft. Daher führt die Namenode die Schreibvorgänge weder durch noch koordiniert sie diese. Sie dient lediglich als Verzeichnisdienst: Sie sagt dem Client, wo ein Block hingeschrieben wird, und der Client sendet diesen Block an die entsprechende Datanode. Diese schreibt ihn lokal und reicht in an die zweite Datanode weiter - dieser Traffic ist aber Rack-intern. Die zweite Datanode schreibt sich den Block ebenfalls auf eine Platte und reicht ihn nun über die Rackgrenze und die damit involvierten Switches hinweg an eine Node in einem anderen Rack weiter, die den Block ebenfalls noch ein drittes Mal schreibt. Die Bestätigungen für diese Operationen laufen denselben Weg den sie gekommen sind wieder zurück (und gehen parallel dazu auch noch einmal an die Namenode) und so weiß der Client, wenn er eine Bestätigung gesehen hat, daß alles geklappt hat und der Block jetzt redundant und persistent gespeichert ist.

Da wir von jedem Block 3 Kopien anlegen, bedeutet das natürlich, daß wir für ein Terabyte Nutzdaten 3 Terabyte Plattenplatz (und ein wenig Metadaten) wegnaschen.

Hadoop versucht außerdem, die Blöcke einer Datei möglichst breit über den Cluster zu schmieren, also eine Datei über möglichst viele Datanodes zu verteilen. Das hat einerseits Geschwindigkeitsvorteile, wenn man parallel schreibt, andererseits macht es die spätere Verarbeitung der Daten schneller.

So können wir eine Datei zum Beispiel lesen, indem wir bei der Namenode eine Blockliste für die gesuchte Datei anfordern und dann parallel von allen Nodes, die die Daten haben, aus dem Netzwerk laden. Mehr Knoten bedeutet hier mehr CPUs und mehr Plattenspindeln, also mehr Speed. Das ist besonders dann interessant, wenn Daten von einem Cluster zu einem anderen kopiert werden - so eine massiv parallele Datenverschiebung bringt jede Netzwerkinfrastruktur an die Sättigungsgrenze. Und das, obwohl wir billige Einzelkomponenten eingekauft haben.

Der Punkt ist, daß HDFS diesen Komponenten nicht traut: Datanodes müssen sich alle paar Sekunden bei ihrer Namenode per TCP Heartbeat melden, und in regelmäßigen Abständen auch Blockreports machen - dadurch weiß die Namenode, welche Blocks zu welcher Platte in einer Datanode gehören, wieviel freier Platz vorhanden ist usw.

Fällt eine von den Datanodes um oder geht auch nur eine Platte in der Datanode offline, geht die Namenode los und weist die überlebenden Datanodes für einen Block an, die notwendige Anzahl von Blockkopien wieder herzustellen - der Cluster flackert kurz mit den Plattenlampen und alles ist wieder gut - sogar, falls irgend möglich, im Rahmen der Redundanzregeln des Rackverteilungsplans.

Irgendwann später schickt man einen Azubi mit einem Einkaufskorb voller Austauschplatten, Gehörschutz und dem Auftrag auszumisten in das RZ und danach stimmt die Clusterkapazität wieder.

Was passiert, wenn eine Platte in einer Datanode nicht umfällt, sondern schimmelig wird und die Daten darauf verändert? HDFS speichert großzügig Prüfsummen an jedem Objekt und würde dies vergleichsweise schnell mitbekommen - entweder beim nächsten Zugriff oder wenn der Cluster sich langweilt und aus Verlegenheit sowieso mal seine Prüfsummen durchprüft. Blöcke mit kaputten Prüfsummen werden kurzerhand abgemurkst, dann stimmt aber die Anzahl der Kopien für diesen Block nicht mehr und die Namenode wird tätig wie oben, um diese Situation zu korrigieren.

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